MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015574	TTTG	2	8	96292	96299	0 %	75 %	25 %	0 %	333986320
1502	NC_015574	GAATGA	2	12	96311	96322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333986320
1503	NC_015574	GAA	2	6	96945	96950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986321
1504	NC_015574	AGC	2	6	96953	96958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986321
1505	NC_015574	A	6	6	96961	96966	100 %	0 %	0 %	0 %	333986321
1506	NC_015574	GGA	2	6	97032	97037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986321
1507	NC_015574	CAA	2	6	97048	97053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986321
1508	NC_015574	ACA	2	6	97119	97124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986321
1509	NC_015574	GGA	2	6	97160	97165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986321
1510	NC_015574	AGT	2	6	97184	97189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986321
1511	NC_015574	TCAA	2	8	97232	97239	50 %	25 %	0 %	25 %	333986321
1512	NC_015574	ATG	2	6	97293	97298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986321
1513	NC_015574	TAC	2	6	97305	97310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986321
1514	NC_015574	TTG	2	6	97333	97338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986321
1515	NC_015574	TGG	2	6	97394	97399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986321
1516	NC_015574	CAT	2	6	97478	97483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986321
1517	NC_015574	GACA	2	8	97516	97523	50 %	0 %	25 %	25 %	333986321
1518	NC_015574	ACT	2	6	97565	97570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986321
1519	NC_015574	A	6	6	97587	97592	100 %	0 %	0 %	0 %	333986321
1520	NC_015574	TGT	2	6	97604	97609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986321
1521	NC_015574	AGA	2	6	97613	97618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986321
1522	NC_015574	TGA	2	6	97634	97639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986321
1523	NC_015574	A	6	6	97652	97657	100 %	0 %	0 %	0 %	333986321
1524	NC_015574	GAT	2	6	97658	97663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986321
1525	NC_015574	AAC	2	6	97809	97814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986322
1526	NC_015574	GAA	2	6	97825	97830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986322
1527	NC_015574	TG	3	6	97876	97881	0 %	50 %	50 %	0 %	333986322
1528	NC_015574	GAA	2	6	97930	97935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986322
1529	NC_015574	GAA	2	6	98002	98007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986322
1530	NC_015574	ATT	2	6	98066	98071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986322
1531	NC_015574	TGGA	2	8	98077	98084	25 %	25 %	50 %	0 %	333986322
1532	NC_015574	A	6	6	98099	98104	100 %	0 %	0 %	0 %	333986322
1533	NC_015574	AGA	2	6	98305	98310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986323
1534	NC_015574	GAA	2	6	98416	98421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986323
1535	NC_015574	GTT	2	6	98477	98482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986323
1536	NC_015574	ATGGC	2	10	98487	98496	20 %	20 %	40 %	20 %	333986323
1537	NC_015574	AT	3	6	98624	98629	50 %	50 %	0 %	0 %	333986323
1538	NC_015574	ACG	2	6	98656	98661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986323
1539	NC_015574	TGA	2	6	98662	98667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1540	NC_015574	CTT	2	6	98841	98846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986323
1541	NC_015574	GAAGGT	2	12	98847	98858	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333986323
1542	NC_015574	CGA	2	6	98999	99004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986323
1543	NC_015574	ATA	2	6	99015	99020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986323
1544	NC_015574	ACA	2	6	99037	99042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986323
1545	NC_015574	TGA	2	6	99131	99136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1546	NC_015574	ATA	2	6	99141	99146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986323
1547	NC_015574	CAT	2	6	99154	99159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1548	NC_015574	TTG	2	6	99160	99165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986323
1549	NC_015574	GTT	2	6	99186	99191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986323
1550	NC_015574	CAG	2	6	99214	99219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986323
1551	NC_015574	TA	3	6	99222	99227	50 %	50 %	0 %	0 %	333986323
1552	NC_015574	GA	3	6	99334	99339	50 %	0 %	50 %	0 %	333986323
1553	NC_015574	GAT	2	6	99353	99358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1554	NC_015574	AAAACC	2	12	99376	99387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986323
1555	NC_015574	CAA	2	6	99406	99411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986323
1556	NC_015574	AAT	2	6	99443	99448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986323
1557	NC_015574	A	6	6	99528	99533	100 %	0 %	0 %	0 %	333986323
1558	NC_015574	TGA	2	6	99608	99613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1559	NC_015574	A	6	6	99652	99657	100 %	0 %	0 %	0 %	333986323
1560	NC_015574	TAC	2	6	99717	99722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1561	NC_015574	A	6	6	99789	99794	100 %	0 %	0 %	0 %	333986323
1562	NC_015574	ATA	2	6	99798	99803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986323
1563	NC_015574	CTA	2	6	99836	99841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1564	NC_015574	TGA	2	6	99899	99904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1565	NC_015574	ACT	2	6	99979	99984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1566	NC_015574	ACC	2	6	100030	100035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986323
1567	NC_015574	CCA	2	6	100052	100057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986323
1568	NC_015574	GCA	2	6	100059	100064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986323
1569	NC_015574	TTG	2	6	100096	100101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986323
1570	NC_015574	TCA	2	6	100137	100142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1571	NC_015574	TGT	2	6	100196	100201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986323
1572	NC_015574	GA	4	8	100250	100257	50 %	0 %	50 %	0 %	333986323
1573	NC_015574	GAA	2	6	100317	100322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986323
1574	NC_015574	A	6	6	100374	100379	100 %	0 %	0 %	0 %	333986323
1575	NC_015574	ATT	2	6	100478	100483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986323
1576	NC_015574	ACT	2	6	100507	100512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986323
1577	NC_015574	GAT	2	6	100536	100541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1578	NC_015574	GCA	2	6	100626	100631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986323
1579	NC_015574	GAA	2	6	100632	100637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986323
1580	NC_015574	CTT	2	6	100678	100683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986323
1581	NC_015574	GAA	2	6	100731	100736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986323
1582	NC_015574	ACA	2	6	100918	100923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986323
1583	NC_015574	ATG	2	6	101065	101070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986323
1584	NC_015574	AACC	2	8	101071	101078	50 %	0 %	0 %	50 %	333986323
1585	NC_015574	TA	5	10	101126	101135	50 %	50 %	0 %	0 %	333986323
1586	NC_015574	AAT	2	6	101137	101142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986323
1587	NC_015574	ATC	2	6	101645	101650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986324
1588	NC_015574	TGGT	2	8	101705	101712	0 %	50 %	50 %	0 %	333986324
1589	NC_015574	CCG	2	6	101837	101842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986324
1590	NC_015574	AT	3	6	101848	101853	50 %	50 %	0 %	0 %	333986324
1591	NC_015574	CAT	2	6	101856	101861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986324
1592	NC_015574	T	6	6	101863	101868	0 %	100 %	0 %	0 %	333986324
1593	NC_015574	ATG	2	6	101872	101877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986324
1594	NC_015574	CTT	2	6	101880	101885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986324
1595	NC_015574	ATAA	2	8	101941	101948	75 %	25 %	0 %	0 %	333986324
1596	NC_015574	CAC	2	6	102061	102066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986324
1597	NC_015574	TTC	2	6	102124	102129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986324
1598	NC_015574	GATT	2	8	102174	102181	25 %	50 %	25 %	0 %	333986324
1599	NC_015574	T	6	6	102213	102218	0 %	100 %	0 %	0 %	333986324
1600	NC_015574	T	6	6	102435	102440	0 %	100 %	0 %	0 %	333986325
1601	NC_015574	TCA	2	6	102521	102526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986325
1602	NC_015574	T	6	6	102587	102592	0 %	100 %	0 %	0 %	333986325
1603	NC_015574	T	7	7	102611	102617	0 %	100 %	0 %	0 %	333986325
1604	NC_015574	GAT	2	6	102657	102662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986325
1605	NC_015574	GGT	2	6	102668	102673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986325
1606	NC_015574	GGT	2	6	102684	102689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986325
1607	NC_015574	GATAT	2	10	102709	102718	40 %	40 %	20 %	0 %	333986325
1608	NC_015574	GTT	2	6	102945	102950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986325
1609	NC_015574	TTC	2	6	102951	102956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986325
1610	NC_015574	CAA	2	6	103001	103006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986325
1611	NC_015574	TCCT	2	8	103142	103149	0 %	50 %	0 %	50 %	333986325
1612	NC_015574	A	6	6	103455	103460	100 %	0 %	0 %	0 %	333986326
1613	NC_015574	TTG	2	6	103484	103489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986326
1614	NC_015574	A	6	6	103501	103506	100 %	0 %	0 %	0 %	333986326
1615	NC_015574	ATT	2	6	103512	103517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986326
1616	NC_015574	TGA	2	6	103572	103577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986326
1617	NC_015574	TAA	2	6	103580	103585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986326
1618	NC_015574	A	7	7	103592	103598	100 %	0 %	0 %	0 %	333986326
1619	NC_015574	GAT	2	6	103666	103671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986326
1620	NC_015574	GAT	2	6	103770	103775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986326
1621	NC_015574	ACA	2	6	103786	103791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986326
1622	NC_015574	AAAG	2	8	103901	103908	75 %	0 %	25 %	0 %	333986326
1623	NC_015574	CTCA	2	8	103988	103995	25 %	25 %	0 %	50 %	333986326
1624	NC_015574	CTT	2	6	104017	104022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986326
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1747	NC_015574	TAT	2	6	112720	112725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986336
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1981	NC_015574	CGT	2	6	127857	127862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986346
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1988	NC_015574	ATC	2	6	128179	128184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986346
1989	NC_015574	GTC	2	6	128242	128247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986346
1990	NC_015574	CAG	2	6	128294	128299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986346
1991	NC_015574	GTC	2	6	128392	128397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986346
1992	NC_015574	TTC	2	6	128554	128559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986346
1993	NC_015574	CAT	2	6	128971	128976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986347
1994	NC_015574	CATT	2	8	128982	128989	25 %	50 %	0 %	25 %	333986347
1995	NC_015574	TCT	2	6	129039	129044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986347
1996	NC_015574	GGT	2	6	129045	129050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986347
1997	NC_015574	CTG	2	6	129076	129081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986347
1998	NC_015574	TGC	2	6	129089	129094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986347
1999	NC_015574	T	6	6	129119	129124	0 %	100 %	0 %	0 %	333986347
2000	NC_015574	TCT	2	6	129228	129233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986347

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